ลำดับ	ภาพรางวัล	ประจำปี	ชื่อรางวัล	รายละเอียดรางวัล	มอบโดย
		2548	รางวัลบัณณาสสมโภช	รางวัลพระราชทานจากสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดา ฯ สยามบรมราชกุมารี มอบให้โรงเรียนที่มีผลการดำเนินกิจกรรมส่งเสริมการเรียนการสอนวิทยาศาสตร์ดีเด่น	จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย
		2553	รางวัลบัณณาสสมโภช	รางวัลพระราชทานจากสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดา ฯ สยามบรมราชกุมารี มอบให้โรงเรียนที่มีผลการดำเนินกิจกรรมส่งเสริมการเรียนการสอนวิทยาศาสตร์ดีเด่น	จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย
		2555	รางวัลโครงการวิทยาศาสตร์สู่ความเป็นเลิศ (Thailand Public Service Awards) ในฐานะโรงเรียนที่มีการจัดการเรียนการสอนวิทยาศาสตร์เพื่อการพัฒนาอย่างยั่งยืน	ได้รับรางวัลในฐานะโรงเรียนที่มีการจัดการเรียนการสอนวิทยาศาสตร์เพื่อการพัฒนาอย่างยั่งยืน มีการนำความรู้ทางวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีมาสร้างสรรค์ประโยชน์ต่อสังคมอย่างเป็นรูปธรรมจนเป็นที่ประจักษ์	วุฒิสภา
		2556	ผลประเมินผ่านเกณฑ์ ในการปฏิบัติตามข้อแนะนำสุขลักษณะที่ดีของครัวผลิตอาหารสำหรับคนหมู่มาก จากโครงการสร้างความเชื่อมั่นอาหารไทยปลอดภัยมีคุณภาพ (Eat Safe Eat Smart)	ร้านอาหารในโรงอาหารของโรงเรียนมหิดลวิทยานุสรณ์ได้รับการตรวจประเมินตามข้อแนะนำสุขลักษณะที่ดีในการผลิตอาหาร โดยผลประเมินปรากฏว่าผ่านเกณฑ์	สถาบันอาหาร กระทรวงอุตสาหกรรม
		2556	รางวัลบริการภาครัฐแห่งชาติ ในด้านการพัฒนาการบริการที่เป็นเลิศ ระดับดีเด่น	ได้รับรางวัลจากผลงาน “การพัฒนานักเรียนที่มีความสามารถพิเศษด้านคณิตศาสตร์และวิทยาศาสตร์”	สำนักงานคณะกรรมการพัฒนาระบบราชการ (ก.พ.ร.)
		2557	ผลประเมินระดับดีมาก จากโครงการ "ครัวอาหารของไทย ก้าวไกลมาตรฐานสากล"	ร้านอาหารในโรงอาหารของโรงเรียนมหิดลวิทยานุสรณ์ผ่านเกณฑ์ดีเยี่ยม จากการประเมินการจัดการสุขลักษณะที่ดีในการผลิตอาหาร	สถาบันอาหาร กระทรวงอุตสาหกรรม
		2556-2557	รางวัลหน่วยงานของรัฐที่ปฏิบัติตามเกณฑ์มาตรฐานตัวชี้วัดความโปร่งใสของหน่วยงานภาครัฐที่กำหนดภายใต้พระราชบัญญัติข้อมูลข่าวสารของราชการ พ.ศ. 2540 ระดับดีเด่น	สำนักงานปลัดสำนักนายกรัฐมนตรี ได้กำหนดให้หน่วยงานรัฐจัดตั้งศูนย์ข้อมูลข่าวสารของราชการขึ้น รางวัลนี้มอบแก่โรงเรียนมหิดลวิทยานุสรณ์ในฐานะเป็นหน่วยงานต้นแบบในการจัดตั้งศูนย์ข้อมูลข่าวสารของราชการ	สำนักนายกรัฐมนตรี
		2558	รางวัลบัณณาสสมโภช	รางวัลพระราชทานจากสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดา ฯ สยามบรมราชกุมารี มอบให้โรงเรียนที่มีผลการดำเนินกิจกรรมส่งเสริมการเรียนการสอนวิทยาศาสตร์ดีเด่น	จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย
		2557 และ 2558	ผลการประเมินคุณธรรมและความโปร่งใสในการดำเนินงานของหน่วยงานภาครัฐ (Integrity & Transparency Assessment) โดยภาพรวมอยู่ในระดับสูง	ได้รับคะแนนสูงสุดเป็นลำดับที่ 10 ของหน่วยงานภาครัฐ จาก 115 หน่วยงาน และเป็นคะแนนสูงสุดขององค์การมหาชน จาก 50 หน่วยงาน 2 ปีซ้อน	สำนักงานคณะกรรมการป้องกันและปราบปรามการทุจริตแห่งชาติ (สำนักงาน ป.ป.ช.)
		2558	รางวัลสถานศึกษาดีเด่น จากการประเมินคุณภาพภายนอก	เป็นรางวัลจากการประเมินคุณภาพและมาตรฐานในการจัดการเรียนการสอนและการบริหารจัดการ	สำนักงานรับรองมาตรฐานและประเมินคุณภาพการศึกษา (องค์การมหาชน) หรือ สมศ.
		2559	รางวัลบริการภาครัฐแห่งชาติ (Thailand Public Service Awards) ในด้านการพัฒนาการบริการที่เป็นเลิศ ระดับดี	ได้รับรางวัลจากผลงาน “โครงการพัฒนาความรู้ทางวิชาการด้านคณิตศาสตร์ วิทยาศาสตร์ และเทคโนโลยี สำหรับครูระดับมัธยมศึกษาตอนปลาย ที่จัดการเรียนการสอนนักเรียนห้องเรียนวิทยาศาสตร์ สังกัด สพฐ.”	คณะกรรมการพัฒนาระบบราชการ (ก.พ.ร.)
		2559	รางวัล Thailand IPv6 Ready Award ในฐานะหน่วยงานที่ประสบความสำเร็จในการดำเนินการปรับเปลี่ยนเครือข่ายไปสู่ IPv6	โรงเรียนมหิดลวิทยานุสรณ์ได้ดำเนินการปรับเปลี่ยนโพรโทรคอลอินเทอร์เน็ตจากเครือข่ายเดิมไปสู่ IPv6 ตามมติคณะรัฐมนตรีที่ให้หน่วยงานต่างๆ ดำเนินการพัฒนาโครงสร้างพื้นฐาน การพัฒนาบุคลากร การส่งเสริมการให้บริการ และการสร้างความตระหนักและให้ความรู้ในการใช้งาน IPv6 เมื่อดำเนินการเสร็จเรียบร้อยแล้ว โรงเรียนจึงได้รับรางวัลดังกล่าวในฐานะที่ประสบความสำเร็จในการดำเนินการ	กระทรวงเทคโนโลยีสารสนเทศและการสื่อสาร (ชื่อกระทรวงในขณะนั้น ปัจจุบันเปลี่ยนมาเป็นกระทรวงดิจิทัลเพื่อเศรษฐกิจและสังคม)
		2560	รางวัล Thailand IPv6 Award 2017	รางวัลสำหรับหน่วยงานที่ให้บริการเครือข่ายอินเทอร์เน็ตพื้นฐาน 3 ด้าน คือ เว็บไซต์ (Website) จดหมายอิเล็กทรอนิกส์ (e-mail) และโดเมนเนม (DNS)	กระทรวงดิจิทัลเพื่อเศรษฐกิจและสังคม
		2560	โรงเรียนแบบอย่างด้านการพัฒนาและส่งเสริมคุณธรรม จริยธรรมให้นักเรียนเป็นผู้มีจิตสาธารณะร่วมแบ่งปันช่วยเหลือเด็กในครอบครัวยากไร้	รางวัลในโครงการ "The Heart of Giving" ประจำปีการศึกษา 2560	มูลนิธิศุภนิมิตแห่งประเทศไทย
		2560	รางวัลองค์การมหาชนดีเด่น ประจำปี พ.ศ. 2560	รางวัลสำหรับองค์การมหาชนที่มีการบริหารจัดการดีเด่น	คณะกรรมการพัฒนาและส่งเสริมองค์การมหาชน (กพม.)
		2561	รางวัลการประเมินคุณธรรมและความโปร่งใสในการดำเนินงานของหน่วยงานภาครัฐ ประจำปีงบประมาณ พ.ศ. 2561(ITA Awards)	โรงเรียนมหิดลวิทยานุสรณ์เป็นหน่วยงานที่มีผลคะแนนการประเมินคุณธรรมและความโปร่งใสในการดำเนินงานของหน่วยงานรัฐ ประเภทองค์การมหาชน ประจำปีงบประมาณ พ.ศ. 2561 สูงสุด	สำนักงานคณะกรรมการป้องกันและปราบปรามการทุจริตแห่งชาติ (ป.ป.ช.)
		2561	รางวัล Thailand IPv6 Award 2018	รางวัลสำหรับหน่วยงานที่มีความพร้อมในการบริการเครือข่ายอินเทอร์เน็ตพื้นฐานและบริการที่รองรับ IPv6 และผ่านเกณฑ์ที่กำหนด	กระทรวงดิจิทัลเพื่อเศรษฐกิจและสังคม